《宝可梦传说：阿尔宙斯》将有别于至今《宝可梦》系列游戏的崭新体验，在重视原有游戏特色的同时，前所未有地挑战融合了动作与角色扮演的展现方式。舞台设置在古代的神奥地区，当时还没有宝可梦训练家和宝可梦联盟的概念，生态环境亦有不同。主角将受博士委托，在木木枭、火球鼠、水水獭中选择一只宝可梦作为最初的伙伴去收集宝可梦图鉴。