《地面控制2：脱逃计划》年代设定在第一代《地面控制》的300年之后，在这个世界中，巨无霸企业之间为了利益而彼此征战，而在“独立战役”中，星际之间的通讯网路也受到波及惨遭摧毁，而外界的殖民地更因此被孤立在核心网络系统之外。因此，经过了数十年，这些殖民地决定组成一个新的政府——NSA联盟。
经过两个世纪后，NSA联盟与核心系统间的通讯网路才重建完成，但在这些年之中，原本星际战争中的胜利一方建立了新的极权组织——Terra帝国，控制的势力范围则包括了地球。而在Terra帝国也要求NSA联盟重回到其控制范围之下，但因为协商破裂，战争也就此展开。
　　游戏中玩家将扮演Jacob Angelus，即是NSA联盟的军事指挥官。主要任务便是联合其它几个游戏中的主要角色，一起率领NSA联盟取得对抗帝国的胜利。