《星球大战：帝国战争》的时间设定在《星战前传3：西斯的复仇》之后和《星球大战4：新的希望》之前的两年的这段时间，因此，本作在剧情上有着承前启后的重要地位，游戏将重点放在展示星系中的战斗场面上，玩家在游戏中可以自行选择帝国军队或是反叛同盟，叛军的舰队攻击星际驱逐舰等等激烈的星际间的战斗即将全面爆发。整款游戏战斗划分为地面战和空间战，空间战类似于海战，玩家主要通过各种大型舰艇进行战斗，当然某些大型舰艇也可以对地面造成攻击，同样地面的远程大炮也可以打到低空飞行的星际飞船，地面上的作战单位也可借助载具将之运送到星际上作战。